Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH3

3300002I08Rik, RIKEN cDNA 3300002I08, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3300002I08RikQ9CXH3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
3300002I08RikQ9CXH3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
3300002I08RikQ9CXH3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
3300002I08RikQ9CXH3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
3300002I08RikQ9CXH3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
3300002I08RikQ9CXH3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
3300002I08RikQ9CXH3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
3300002I08RikQ9CXH3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
3300002I08RikQ9CXH3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
3300002I08RikQ9CXH3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
3300002I08RikQ9CXH3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
3300002I08RikQ9CXH3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
3300002I08RikQ9CXH3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
3300002I08RikQ9CXH3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
3300002I08RikQ9CXH3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
3300002I08RikQ9CXH3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
3300002I08RikQ9CXH3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
3300002I08RikQ9CXH3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
3300002I08RikQ9CXH3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
3300002I08RikQ9CXH3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
3300002I08RikQ9CXH3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
3300002I08RikQ9CXH3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
3300002I08RikQ9CXH3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
3300002I08RikQ9CXH3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
3300002I08RikQ9CXH3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
3300002I08RikQ9CXH3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
3300002I08RikQ9CXH3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
3300002I08RikQ9CXH3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
3300002I08RikQ9CXH3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms