Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmd8Q9CX56 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmd8Q9CX56 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms