Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Yif1bQ9CX30 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Yif1bQ9CX30 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms