Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rbm8aQ9CWZ3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm8aQ9CWZ3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rbm8aQ9CWZ3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rbm8aQ9CWZ3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Rbm8aQ9CWZ3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm8aQ9CWZ3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm8aQ9CWZ3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm8aQ9CWZ3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm8aQ9CWZ3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm8aQ9CWZ3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm8aQ9CWZ3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm8aQ9CWZ3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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