Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpusd4Q9CWX4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms