Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkrip1Q9CWV6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkrip1Q9CWV6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkrip1Q9CWV6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms