Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Malsu1Q9CWV0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Malsu1Q9CWV0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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