Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CWU4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CWU4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CWU4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CWU4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CWU4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CWU4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CWU4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CWU4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CWU4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CWU4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CWU4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CWU4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CWU4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms