Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smyd3Q9CWR2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms