Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms