Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms