Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc43Q9CR29 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc43Q9CR29 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms