Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931417E11RikQ9CR05 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms