Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tma16Q9CR02 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tma16Q9CR02 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tma16Q9CR02 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tma16Q9CR02 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tma16Q9CR02 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tma16Q9CR02 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tma16Q9CR02 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tma16Q9CR02 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tma16Q9CR02 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tma16Q9CR02 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tma16Q9CR02 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms