Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifitm3Q9CQW9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifitm3Q9CQW9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms