Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccer1Q9CQL2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccer1Q9CQL2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms