Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rwdd1Q9CQK7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rwdd1Q9CQK7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms