Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DenrQ9CQJ6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DenrQ9CQJ6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DenrQ9CQJ6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DenrQ9CQJ6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DenrQ9CQJ6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DenrQ9CQJ6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DenrQ9CQJ6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DenrQ9CQJ6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms