Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snrpb2Q9CQI7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms