Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms