Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nudcd2Q9CQ48 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms