Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rtn4Q99P72 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rtn4Q99P72 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtn4Q99P72 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtn4Q99P72 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtn4Q99P72 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtn4Q99P72 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtn4Q99P72 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtn4Q99P72 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtn4Q99P72 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtn4Q99P72 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtn4Q99P72 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtn4Q99P72 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtn4Q99P72 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtn4Q99P72 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtn4Q99P72 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtn4Q99P72 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtn4Q99P72 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rtn4Q99P72 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms