Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rassf3Q99P51 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rassf3Q99P51 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms