Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bco2Q99NF1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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