Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Hdac9Q99N13 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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