Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SrrtQ99MR6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms