Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cdk5rap3Q99LM2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cdk5rap3Q99LM2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdk5rap3Q99LM2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdk5rap3Q99LM2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdk5rap3Q99LM2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdk5rap3Q99LM2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms