Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp16Q99LG0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp16Q99LG0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms