Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nmd3Q99L48 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nmd3Q99L48 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms