Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PpifQ99KR7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PpifQ99KR7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms