Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ5

Tcf19, Transcription factor 19-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf19Q99KJ5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcf19Q99KJ5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcf19Q99KJ5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcf19Q99KJ5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcf19Q99KJ5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tcf19Q99KJ5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcf19Q99KJ5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms