Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn2aQ99KJ0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms