Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlgn1Q99K10 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlgn1Q99K10 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms