Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pacsin3Q99JB8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pacsin3Q99JB8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms