Protein–RNA interactions for Protein: Q99J27

Slc33a1, Acetyl-coenzyme A transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc33a1Q99J27 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc33a1Q99J27 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc33a1Q99J27 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms