Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn16Q925N4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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