Protein–RNA interactions for Protein: Q923S6

Neurl1, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1Q923S6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurl1Q923S6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neurl1Q923S6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms