Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd1Q923L3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms