Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim59Q922Y2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim59Q922Y2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms