Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp4Q921I6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms