Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med28Q920D3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms