Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trpm2Q91YD4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpm2Q91YD4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trpm2Q91YD4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trpm2Q91YD4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms