Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usb1Q91W78 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms