Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp3Q91W36 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms