Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crb1Q8VHS2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crb1Q8VHS2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms