Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cul7Q8VE73 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cul7Q8VE73 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cul7Q8VE73 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms