Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SnrkQ8VDU5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms