Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep57l1Q8VDS7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cep57l1Q8VDS7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep57l1Q8VDS7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep57l1Q8VDS7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep57l1Q8VDS7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep57l1Q8VDS7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep57l1Q8VDS7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep57l1Q8VDS7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep57l1Q8VDS7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep57l1Q8VDS7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep57l1Q8VDS7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep57l1Q8VDS7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep57l1Q8VDS7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cep57l1Q8VDS7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cep57l1Q8VDS7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep57l1Q8VDS7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep57l1Q8VDS7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep57l1Q8VDS7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep57l1Q8VDS7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep57l1Q8VDS7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep57l1Q8VDS7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep57l1Q8VDS7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep57l1Q8VDS7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep57l1Q8VDS7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep57l1Q8VDS7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep57l1Q8VDS7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep57l1Q8VDS7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep57l1Q8VDS7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep57l1Q8VDS7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep57l1Q8VDS7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep57l1Q8VDS7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms