Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fyco1Q8VDC1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fyco1Q8VDC1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms