Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rapgef3Q8VCC8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rapgef3Q8VCC8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rapgef3Q8VCC8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rapgef3Q8VCC8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rapgef3Q8VCC8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rapgef3Q8VCC8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rapgef3Q8VCC8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rapgef3Q8VCC8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rapgef3Q8VCC8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rapgef3Q8VCC8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rapgef3Q8VCC8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rapgef3Q8VCC8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rapgef3Q8VCC8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rapgef3Q8VCC8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rapgef3Q8VCC8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rapgef3Q8VCC8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rapgef3Q8VCC8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rapgef3Q8VCC8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rapgef3Q8VCC8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rapgef3Q8VCC8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rapgef3Q8VCC8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rapgef3Q8VCC8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rapgef3Q8VCC8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rapgef3Q8VCC8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rapgef3Q8VCC8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rapgef3Q8VCC8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rapgef3Q8VCC8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rapgef3Q8VCC8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rapgef3Q8VCC8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rapgef3Q8VCC8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
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